活动:表达谱挖掘云平台GENEVESTIGATOR®免费试用

[db:作者] - 2020-08-18

目前,全球累积确诊感染新型冠状病毒的人数突破一百六十万,各地的科学家和研究人员都在紧锣密鼓地开展相关研究,期望能找出尽快结束这场战役的方法。作为致力于基因组学分析的一员,上海康昱盛也希望能在自己的领域尽一份绵薄之力。

在上月,康昱盛联合凯杰公司开展了IPA & CLC软件的免费试用活动,其中IPA能够助力揭示新冠感染机制和潜在靶点,CLC能够助力分析新冠基因序列和进化路线。而现在,康昱盛联合NEBION公司,为正在新冠研究一线奋斗的科研人员提供了另一款强大的分析软件的免费试用:

转录组表达谱挖掘比对平台GENEVESTIGATOR®免费试用一个月!
没有新冠转录组数据?没有分析方向?GENEVESTIGATOR®为您轻松解决!


GENEVESTIGATOR®是基因表达的高性能搜索引擎。它集成了上万由专家人工统一精选、注释与归一化的公共基因芯片和二代测序的实验结果,包含了各大开源或私人的数据库中的表达谱,全部样本数目超过32万,人类样本数目超过23万,用于人类的基因芯片或测序平台多达26种,所涉及的疾病超过500种。GENEVESTIGATOR®将基因在不同的生物环境,包括疾病、药物、组织部位、肿瘤、细胞系或基因型之中的表达进行了可视化,以探索不同生物环境下不同基因的表达情况以及基因与生物环境的潜在深层联系。

 
导向1:从基因出发,探索新冠相关基因在不同情况下的表达

在前期的新冠研究中,科学家已经发掘出一系列新冠相关基因。而GENEVESTIGATOR®可以探索这些特定基因在不同生物环境下的表达情况,包括不同组织、细胞系、癌症、疾病、药物和发育期。研究人员可以自由探索新冠相关基因(如新冠重要受体ACE2)在不同组织中的表达情况,判断病毒影响较大的人体组织器官,推断新冠影响人体的路径;可以探索新冠相关基因在不同性别或年龄层的表达情况,研究病毒针对男女或老年人年轻人的不同影响;甚至可以探索新冠相关基因在不同药物或化合物中的表达情况,挖掘潜在治疗新冠病毒感染的药物。以上这些探索不需要研究人员提供数据,GENEVESTIGATOR®能直接提供分析灵感和文献支持。



导向2:从生物环境出发,探索新冠可能影响的特定基因

新冠属于β型冠状病毒,和SARS-CoV的基因序列具有很高的相似性,并且共享相同的细胞表面受体ACE2。GENEVESTIGATOR®可以找出在特定生物环境下,包括不同组织、细胞系、癌症、疾病、药物和发育期,高表达或低表达的基因。例如,可以计算挑出在SARS-CoV影响下特异性高表达或低表达的基因,这些基因很有可能同样在新冠影响下特异性表达,甚至可以成为疾病marker或者治疗新冠的靶点候选。



导向3:结合基因与生物环境,探索新冠相关基因之间的潜在联系

同时,GENEVESTIGATOR®还支持相关性分析,挖掘出更多在不同生物环境下和目标新冠相关基因具有潜在关联性的基因,还可以对这些基因进行聚类分析和功能富集分析,进一步探索它们的内部联系和生物功能。此外,如果研究人员能够提供新冠患者转录组数据,GENEVESTIGATOR®还能够计算找出在表达量上具有逆转关系的用药情况,即可能对于新冠具有治疗效果的潜在药物。



活动须知

1.  活动时间:即日起至4月30日。
2.  申请条件:
a)科研院校PI或商业单位发送关于软件的试用申请(请使用单位邮箱,而非通用邮箱如QQ或163邮箱)至marketing@cloudsientific.com
b) 关注康昱盛微信公众号并转发“为新冠研究加油!GENEVESTIGATOR®免费试用一个月!附加免费课程!”本条微信至朋友圈,集齐11个赞,截图。

收到您的申请后,我们将在一个工作日联系您。

参考文献:
[1] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet, DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8
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